Anthropic, YZ modellerini genellikle kapsamlı uzman katkısı gerektiren bir protein tasarımı görevinde test etti. Şirket, harici araştırma ortaklarıyla yürüttüğü deneyde Claude’un 15 biyolojik hedefin 14’ü için bağlayıcı proteinler ürettiğini bildirdi.
Şirket, çalışmanın Claude tarafından üretilen protein dizilimlerini imal eden ve deneysel olarak değerlendiren Adaptyv Bio ve Twist Bioscience ile ortaklaşa yürütüldüğünü açıkladı. Anthropic bu çalışmayı, erken aşama protein tasarımı iş akışının ne kadarının sınırlı insan müdahalesiyle YZ tarafından üstlenilebileceğini değerlendirme çabası olarak tanımladı.
Deney kapsamında Claude Opus 4.8 ve Mythos Preview modellerine, 15 hedefin her biri için 30 aday protein bağlayıcı üretme talimatı verildi. Modeller çalışma boyunca toplam 1.320 tasarım üretti.
Anthropic’e göre, ardından yapılan laboratuvar testlerinde 15 vakadan 14’üne yayılan hedeflere bağlanan 354 tasarım tespit edildi.
YZ Tasarım Sürecinin Birden Fazla Aşamasını Üstlendi
Anthropic, normalde bir protein tasarımı sürecinin parçası olan birden fazla aşamanın sorumluluğunun Claude’a verildiğini belirtti. Modeller olası bağlanma bölgelerini tespit etti, protein yapıları ile dizilimleri oluşturdu, adayları geliştirdi ve potansiyellerini değerlendirmek için özel bilgisayarlı araçlar kullandı.
Şirket, modeller tüm hedef seti üzerinde çalıştığında Opus 4.8 için %22,6, Mythos Preview için ise %26,7 genel başarı oranı bildirdi.
Mythos Preview, her bir hedef bağımsız olarak ele alındığında daha yüksek performans gösterdi ve Anthropic bu senaryoda genel başarı oranını %35,1 olarak açıkladı. Şirket bu oranı, mevcut protein tasarımı süreçlerindeki tipik %10-15 başarı oranıyla karşılaştırdı.
Ancak sonuçlar tüm hedeflerde aynı tutarlılığı göstermedi.
Sonuçlar Hedeflere Göre Değişiklik Gösterdi
En güçlü sonuçlardan biri, daha önce Adaptyv Bio tarafından düzenlenen protein tasarımı yarışmalarında kullanılan bir protein olan RBX1 deneylerinden elde edildi.
Anthropic, Mythos Preview’un özellikle RBX1 üzerinde çalışırken %40 başarı oranı yakaladığını açıkladı. Şirket bu sonucu, önceki yarışmadaki katılımcıların %3,7’lik başarı oranıyla kıyasladı.
Claude ayrıca, iltihabi sinyallerle ilişkilendirilen bir protein olan TNFα için de birden fazla aday bağlayıcı üretti. Anthropic, elde edilen bazı tasarımların TNFα proteininin insan, cynomolgus maymunu ve fare versiyonlarına bağlanabildiğini bildirdi.
Deney bazı sınırlılıkları da ortaya çıkardı. Maltoz bağlayıcı protein (MBP) için üretilen 90 tasarımın hiçbiri bağlayıcı olarak doğrulanamadı fakat Anthropic bir adayın zayıf ama tekrarlanabilir bir sinyal ürettiğini belirtti.
Model, β-varil yapısına sahip başka bir hedef olan BBF-14 ile de sınırlı sonuçlar elde etti. Anthropic, bir hedefe bağlanan protein üretmenin, uygulanabilir bir ilaç adayı geliştirmenin yalnızca tek bir aşaması olduğuna dikkat çekti.
Claude, Laboratuvar Verileri Üzerinde de Test Edildi
Anthropic, Claude’un analitik kimya verilerini yorumlama yeteneğini de ayrıca değerlendirdi.
Modele, anlaşmalı bir laboratuvar tarafından üretilen ham nükleer manyetik rezonans (NMR) ve sıvı kromatografisi-kütle spektrometresi (LC-MS) dosyaları sağlandı. Anthropic, Claude’un bu iki veri setini sırasıyla 23 dakika ve 19 dakikada işlediğini ifade etti.
Bir analizde model, bileşik saflığını laboratuvarın %96,33’lük değerlendirmesine kıyasla %96,4 olarak tahmin etti.
Anthropic, bu deneylerin, bilim insanlarının veri işlemeye ve potansiyel adayları değerlendirmeye yoğun zaman harcadığı araştırma süreçlerinde YZ için olası kullanım alanlarına işaret ettiğini söyledi.
Aynı zamanda şirket, biyolojik araştırmalarla çalışabilen giderek daha otonom hale gelen YZ sistemlerinin çift kullanım riskleri barındırabileceğini kabul etti. Protein tasarımı ve biyolojik araştırmaların diğer alanlarına yönelik yeteneklerin, güvenlik önlemleri ve güvenilir erişim programları geliştirildikçe kısıtlı erişime tabi kalmaya devam ettiğini bildirdi.
Anthropic, Claude’un ilaç geliştirme sürecinin farklı aşamalarında daha geniş bir rol üstlenip üstlenemeyeceğini araştırmayı sürdürdüğünü belirtti. Bununla birlikte deney sonuçları, YZ tarafından üretilen adayların hâlâ laboratuvar doğrulaması gerektirdiğini ve tek başlarına henüz bir ilaç adayı oluşturmadığını da gösteriyor.
Kaynak: https://www.storyboard18.com/digital/anthropic-says-claude-designed-protein-binders-for-14-of-15-targets-in-lab-test-108129.htm
